本ページはプロモーション（アフィリエイト広告）を含みます。
石垣島へ行くと決めたあと、最初につまずくのが航空券です。行き先は1つなのに、羽田から直行で飛ぶのか、那覇で乗り継ぐのか、LCCを使うのかで値段も所要時間も変わります。しかも国内線は搭乗日の355日前から買えるため、「とにかく早く押さえたほうがいい」と言われがちです。ただ石垣線には、早く買っただけでは安心できない事情もあります。この記事では、どこから飛んでいるのか・いつから買えるのか・どの運賃を選ぶのかを、空港と航空会社の公式情報を軸に整理します。
直行便が飛んでいるのは、本土の5空港と那覇
南ぬ島石垣空港が公式サイトで公開している「発着路線」によると、国内線は東京（羽田・成田）・名古屋（中部）・大阪（関西）・福岡・沖縄（那覇）、そして県内の宮古・与那国・多良間・波照間です。本土から直行で飛べるのは5空港で、那覇を加えると直行便のある空港は6つ。それ以外の都市からは那覇などでの乗り継ぎになります。
| 出発地 | 運航している航空会社 |
|---|---|
| 東京（羽田） | 日本航空（JAL）／全日本空輸（ANA） |
| 東京（成田） | Peach |
| 名古屋（中部） | 全日本空輸（ANA） |
| 大阪（関西） | 日本トランスオーシャン航空（JTA）／全日本空輸（ANA）／Peach |
| 福岡 | Peach |
| 沖縄（那覇） | 日本トランスオーシャン航空（JTA）／琉球エアーコミューター（RAC）／全日本空輸（ANA）／ソラシドエア |
| 宮古 | 琉球エアーコミューター（RAC）／全日本空輸（ANA） |
この表で見ておきたいのは会社の顔ぶれよりも社数のほうです。成田と福岡はPeachだけ、中部はANAだけ。つまりその空港から選べる会社が1社しかない路線があるということで、満席のときも、天候で飛ばないときも、同じ日のうちに振り替える先が空港の中にありません。羽田と関西は複数社が飛んでいるぶん、日程が動いたときの逃げ道が広くなります。
実際はどこから来ているのか｜路線別の人数で見る
石垣市は毎月「入域観光推計表」を公表していて、そのなかに路線ごとの入域観光客数があります。2026年1〜7月の累計を多い順に並べると、石垣島に人を運んでいる路線の実力差がはっきり出ます。
| 路線 | 2026年1〜7月の累計（人） |
|---|---|
| 那覇 | 253,001 |
| 羽田 | 183,250 |
| 関西 | 88,442 |
| 成田 | 52,584 |
| 中部 | 29,841 |
| 福岡 | 29,206 |
| 宮古 | 19,630 |
いちばん多いのは那覇で、本土直行の最大である羽田を上回っています。直行便のない都市に住んでいるなら、那覇乗り継ぎは例外的な手段ではなく主流の入り方だということです。乗り継ぎの組み方は別記事にまとめています。
355日前から買える。ただし、そのときダイヤはまだ確定していない
ANAは国内線運賃の公式ページで「搭乗日355日前（日本時間午前9:00）から予約・販売いたします」と案内しています。1年近く前から座席を押さえられるわけですが、同じページにはもう1つ重要な但し書きがあります。「運航ダイヤ確定前に販売を開始いたします」「運航ダイヤ確定時にご予約便の運休または発着時刻、便名、機種、機材、運航会社・座席番号に変更が発生する場合がございます」。
ダイヤが確定する時期も公表されていて、夏ダイヤ（3月の最終日曜日〜10月の最終日曜日の直前の土曜日搭乗分）は1月下旬頃、冬ダイヤ（10月の最終日曜日〜翌年3月の最終日曜日の直前の土曜日搭乗分）は8月下旬頃です。つまり半年以上前に買った便は、あとから時刻が動くことがあります。旅程が成り立たなくなった場合は「ANA便への変更または払い戻しを承ります」とも書かれています。
ここから導ける順番はシンプルです。航空券は早めに押さえてよい。ただし船・離島の宿・ツアーは、ダイヤが確定してから確定させる。石垣島は着いた日に離島へ渡れるかどうかが到着時刻で決まる島なので、到着が30分ずれるだけで初日の予定が崩れます。
もう1つ、355日前だからこそ知っておきたい点があります。売り出された瞬間に、すべての便が並ぶとは限らないことです。毎月沖縄の島々へ通っている旅行者は自身の動画で、ピーチについて「販売開始ですべての便が出るわけじゃない」「石垣や奄美は後から便が増えることがあるので、焦ってはいけない」と振り返り、先に押さえた便より条件のいい便があとから出て、取り直した経験を挙げています（出典：毎月沖縄に通って分かった航空券のリアル｜2026年・夏ダイヤ前に知っておきたいこと）。早めに押さえること自体は正解ですが、発売初日に決め切らなければいけないわけではありません。選択肢は、日程が近づいてから増えることもあります。
運賃は「安いか」より「動かせるか」で選ぶ
同じ便でも運賃の種類によって、変更できるかどうかと支払いの期限が変わります。ANAの国内線運賃はフレックス・スタンダード・シンプル・セールなどに分かれていて、公式ページによるとスタンダードとシンプルの予約期限は「販売開始〜搭乗日45／28／1日前」、支払期限は「予約をしてから24時間後」「事前購入期日当日23:59」「出発時刻24時間前」のうちいちばん早いタイミングです。安い運賃ほど早く締め切られ、支払いも待ってくれません。
LCCも同じ考え方です。Peachは2024年7月3日の公式発表で運賃タイプを「スタンダード」「スタンダードプラス」「ミニマム」の3種類にリニューアルしました。発表によると「スタンダード」は座席指定や預け手荷物（1個）の料金が含まれた運賃、「スタンダードプラス」は「スタンダード」の内容に加えて、便の変更と払い戻しができる運賃（手数料500円を引いて払い戻し）、「ミニマム」は座席指定や預け手荷物などのオプションを必要に応じて選ぶ運賃です。
石垣島は台風の通り道にあり、夏から秋にかけては欠航や遅延が起こります。そのときに打てる手は、手元の航空券が変更できる運賃かどうかでほぼ決まります。最安の運賃を選ぶ前に、その運賃が変更できるのかを確かめる。ここが石垣線でいちばん効く判断です。
買ったあとに確認しておくこと｜カウンターの締切
空港公式の「航空会社一覧」には、各社のチェックインカウンターの場所と営業時間が載っています。JAL・JTA・RACは国内線ターミナル1階北側で7時45分から20時00分まで、ANAとソラシドエアは1階南側（ANAは公式サイトを確認するよう案内）、Peachは1階北側で「出発予定時刻の90分前から30分前まで」です。
Peachの締切は他社より前に閉まります。離島から戻る船が遅れたり、レンタカーの返却に手間取ったりすると、帰りの便に間に合わないことがあります。最終日の予定は、この締切から逆算して組んでください。
まとめ
石垣島の航空券は、本土5空港からの直行と那覇乗り継ぎの2本立てで、実際にいちばん人を運んでいるのは那覇路線です。買えるのは355日前からですが、そのときダイヤはまだ確定しておらず、確定は夏ダイヤで1月下旬頃・冬ダイヤで8月下旬頃。航空券は先に、船・離島の宿・ツアーはダイヤ確定後にという順番にすれば、あとから時刻が動いても旅程ごと崩れません。運賃は安さだけで選ばず、変更できるかどうかを必ず見る。台風の島では、その差が旅そのものを左右します。
参考・出典（公式サイト）
- 南ぬ島石垣空港 発着路線
- 南ぬ島石垣空港 航空会社一覧
- ANA 国内線運賃のご利用について
- Peach Aviation プレスリリース「3つの運賃タイプをリニューアル」（2024年7月3日）
- 石垣市 入域観光客数（観光文化課）
※ 就航路線、運賃の条件、カウンターの営業時間などの情報は変更される場合があります。ご予約の前に各公式サイトで最新情報をご確認ください（最終確認：2026年9月）。