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結論から言うと、石垣島旅行で早く押さえるべきものは航空券と宿の2つです。ANAの国内線は搭乗日355日前の午前9時から予約でき、繁忙期ほど先に売れていきます。一方、離島行きの高速船はWEB予約が乗船日前日18時まで受け付けられており、川平湾のグラスボートは24時間ネット予約ができるため直前の手配で間に合います。この記事では「いつから予約できるか」「どの順番で押さえるか」を、各公式サイトの情報をもとに整理します。
予約の順番の全体像
石垣島旅行の予約は、変更しづらいもの（航空券・宿）から先に確定します。高速船やグラスボートのように直前で間に合うものは後回しでかまいませんが、催行会社の体験ツアーと、事前申請が要る西表島の特定フィールドだけは早めの手配が必要です。まずは全体像を早見表で確認しましょう。
| 押さえるもの | いつから | 直前の目安 |
|---|---|---|
| 航空券（ANA） | 搭乗日355日前の午前9時〜 | 運賃種別により異なる |
| 宿 | 日程が決まり次第 | 繁忙期は早い者勝ち |
| 離島の高速船 | 販売期間が順次開放 | WEB予約は前日18時まで |
| 川平湾グラスボート | 24時間ネット予約・事前決済可 | 直前の手配で間に合う |
| 体験ツアー（幻の島・マンタ等） | 日程が決まり次第 | 満席の日もあり事前予約が基本 |
| 西表島の特定フィールド | 立入希望日の6か月前から申請 | ガイド同行等の条件あり |
航空券｜ANAは搭乗日355日前の午前9時から
南ぬ島石垣空港（新石垣空港）には、東京（羽田・成田）・名古屋（中部）・大阪（関西）・福岡・那覇・宮古・与那国などから直行便が就航しています（2026年9月時点）。運航しているのはJALグループ（JTA・RACを含む）・ANA・Peach・ソラシドエアなどです。
ANAの国内線は、公式サイトの案内で「搭乗日355日前（日本時間午前9:00）から予約・販売いたします」と明記されています。JALグループ（JTAを含む）やPeachは発売開始日の考え方が各社で異なるため、最新の発売開始日は各社公式サイトで確認してください。夏休みや年末年始など混み合う時期は、発売開始と同時に予約する人も多く、日程が決まっているなら早く動くほど選べる便が多くなります。
宿｜航空券を取ったらすぐ押さえる
石垣島の宿は、離島ターミナルや飲食店に歩いて行ける市街地エリアと、ビーチやプールでゆっくり過ごすリゾートエリアに大きく分かれます。どちらに泊まるかで旅の組み立てが変わるため、航空券を取ったら間を置かずに宿も確定させるのがおすすめです。エリアごとの特徴は石垣島の宿の選び方にまとめています。
離島の高速船｜前日までのWEB予約で足りる
竹富島や西表島へ渡る高速船は、数か月前から席を押さえる必要はありません。安栄観光のオンライン乗船券予約は乗船日前日の18時まで受け付けており、販売対象の期間も順次先へ開放されていきます（執筆時点では2026年9月30日乗船分まで購入可能）。運賃の目安は石垣→竹富が大人片道970円・往復1,880円、いちばん遠い波照間が片道4,990円・往復9,670円（燃料油価格変動調整金込み）。航路ごとの運賃は現地にかかるお金の早見表で一覧にしています。
ただし波照間航路など便数の少ない航路は満席になる日もあるため、行く島と日付が決まったらWEB予約を済ませておくと当日の窓口に並ばずに済みます。どの島に渡るか迷っている段階なら、離島の選び方ガイドから検討するのが近道です。
現地ツアー｜直前で間に合うものと、事前手続きが要るもの
川平湾のグラスボート（川平マリンサービス）は、公式サイトのフォームで乗船予約を受け付けており、ネット予約は24時間可能です。事前決済にしておくと当日は余裕をもって乗船できます。始発9:00から15分ごとに出航し、最終は17:00発、乗船は約30分・大人2,300円です。
一方、幻の島（浜島）上陸やマンタのシュノーケルツアーは、催行会社のツアーに申し込む形になるため、日程が決まったら事前予約が基本です。さらに西表島のピナイサーラの滝など特定の5フィールドは、立入希望日の6か月前から受け付ける事前申請とガイド同行等の条件が定められています。詳しくは西表島の立入ルールを確認してください。
直前1週間〜当日｜台風シーズンは運航情報を見る
夏〜秋の石垣島は台風の接近がある時期です。出発前1週間は天気予報と各社の運航情報を確認し、欠航時にどう動くかを台風・欠航対策で予習しておくと落ち着いて対応できます。旅程に予備日を組み込む考え方は3泊4日モデルコースで紹介しています。
なお、空港から市街地への移動は予約不要です。カリー観光の直行バス（空港⇔石垣港離島ターミナル）は大人550円・小人280円で、支払いは車内で現金またはクレジットカードのタッチ決済が使えます。
まとめ
石垣島旅行の予約は、①航空券（ANAは355日前の午前9時から）と②宿を先に固めるのが基本です。離島の船は前日18時までのWEB予約、路線バスは予約不要、グラスボートも24時間ネット予約で直前まで手配できます。ただし、催行会社のツアーと、事前申請が要る西表島の特定フィールドだけは日程が決まった時点で手配を済ませておきましょう。料金・時刻は変わることがあるため、最終確認は各公式サイトでどうぞ。
参考・出典（公式サイト）
- ANA 国内線運賃のご利用について（予約・発売開始日）：https://www.ana.co.jp/ja/jp/serviceinfo/special-info/fare_info/
- 南ぬ島石垣空港（就航路線）：https://www.ishigaki-airport.co.jp/
- 安栄観光（乗船券予約・時刻表/料金）：https://aneikankou.co.jp/reservation
- 川平マリンサービス（川平湾グラスボート）：https://www.kabiramarine.jp/
- カリー観光（石垣空港〜離島ターミナル直行バス）：https://karrykanko.com/ishigaki/
- 竹富町観光協会（各島へのアクセス）：https://painusima.com/access/
- 竹富町（特定自然観光資源の立入承認申請）：https://www.town.taketomi.lg.jp/topics/1724675844/
※ 料金・時刻・運航・発売ルールは変更される場合があります。おでかけ前に各公式サイトで最新情報をご確認ください（最終確認：2026年9月）。